合同补充条款有效。
合同补充条款与合同具有同等法律效力。合同是当事人或当事双方之间设立、变更、终止民事关系的协议。依法成立的合同，受法律保护。当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。